お腹に約5mmの穴を縦方向に2〜3つ開けて手術を行います。 開腹手術だとお腹を大きく開けるので、開腹手術に比べて傷口の大きさをかなり小さく出来ます。

卵巣は背中側に強力な靭帯で付いていて、開腹手術で傷を小さくしようとすればするほど強く引っ張ってお腹の外に出さないといけません。避妊手術で痛いのはまさにここです。開腹手術中にここを引っ張ると、必ずといっていいほど血圧や心拍数が上がります（動物が痛みを感じているサイン）。 腹腔鏡では卵巣が本来ある位置で切除できるので、この痛みはかなり軽減されます。

開腹手術では一泊入院することもありますが、腹腔鏡手術だとほぼ100%の動物が日帰りで手術できます。